Микробиологи из Стэнфордского университета изучили влияние изменений, связанных с индустриализацией и урбанизацией, на развитие микробиома кишечников. Анализ показал, что изменение образа жизни и питания сократило бактериальное разнообразие. Некоторые бактерии, найденные у охотников-собирателей, исчезли у жителей городов.
Исследователи секвенировали кишечные микробиом из образцов фекалий представителей народа хадза — коренного общества охотников-собирателей, сохранившегося на севере Танзании. Полученные данные сравнили с бактериями в кишечниках жителей Непала и Калифорнии.
Анализ показал, что в микробиоме хадза было в среднем 730 видов кишечных микробов. Средний калифорнийский микробиом кишечника содержал всего 277 видов. А непальский — находился между ними: у людей, ведущих фермерский образ жизни, было в среднем 436 видов микробов, а у собирателей —317.
Исследователи обнаружили в микробиомах народа хадза виды бактерий, который не было в образцах из Калифорнии. Например, штопорообразную бактерию Treponema succinifaciens. Интересно, что даже в образцах из кишечников танзанских охотников-собирателей она встречалась не всегда. Исследователи полагают, что эта бактерия постепенно вымирает по мере того, как общества становятся более индустриализированными.
Напротив, в образцах, полученных у представителей «западной» цивилизации, чаще присутствуют бактерии с признаками реакции на окислительное повреждение. Микробиологи полагают, что они связаны с хроническими раздражениями кишечника.
Всего исследователи секвенировали более 90 тыс. геномов микробов, обнаруженных в кишечнике человека, включая бактерии, вирусы, заражающие бактерии, и одноклеточные организмы (археи и эукариоты). Около 44% из них не были описаны в существующих базах данных, а более тысячи принадлежит новым для науки видам бактерий или архей.
Исследователи полагают, что изучение микробиомов представителей традиционных обществ поможет лучше понять, как полезные бактерии реагируют на изменение образа жизни, к каким последствиям для здоровья это может привести и, в конечно счете, как лечить связанные с изменениями заболевания.
