Ученые разработали систему, способную автоматически выявлять потенциально опасные варианты вирусов и бактерий, анализируя их генетические мутации и скорость распространения в популяции. Метод описан в статье в журнале Nature.
Метод анализа изменений вирусов и бактерий, разработанный британскими учеными, использует принцип построения «генеалогического древа» патогенов и может применяться для мониторинга широкого спектра инфекционных заболеваний, включая грипп, COVID — 19, коклюш и туберкулез. В отличие от существующих подходов, новый метод не требует участия экспертов для определения новых вариантов заболеваний.
Система в автоматическом режиме анализирует образцы, полученные от инфицированных пациентов, отслеживая генетические изменения возбудителей в режиме реального времени. Это позволяет быстро выявлять штаммы, способные преодолевать иммунную защиту или устойчивые к антибиотикам. По словам доктора Ноэми Лефранк, соавтора исследования, система даже может прогнозировать, как новые варианты будут распространяться в популяции.
При тестировании технологии на образцах возбудителя коклюша ученые обнаружили три новых ранее неизвестных варианта. Это особенно важно, поскольку во многих странах сейчас наблюдаются самые сильные за последние 25 лет вспышки этого заболевания. Система также успешно идентифицировала два устойчивых к антибиотикам варианта туберкулезной палочки.
Наш метод — абсолютно объективный способ обнаружения новых штаммов болезнетворных микроорганизмов путем анализа их генетики и того, как они распространяются в популяции. Это означает, что мы можем быстро и эффективно выявлять появление новых высококонтагиозных штаммов.
Джулиан Паркхилл, соавтор исследования
Профессор Хенрик Салье, руководитель исследования, добавляет, что новый метод поможет быстрее адаптировать вакцины под появляющиеся варианты патогенов и корректировать схемы лечения при обнаружении устойчивых к антибиотикам штаммов. Исследователи считают, что их разработка может стать важным элементом глобальной системы эпидемиологического надзора.
